Còn tự vệ ở lại giữ trường, bảo vệ cơ sở vật chất, mãi sau này hồi 198x, khi lấy đồ trong kho dự trữ của LX để lại để thay thế hư hỏng, các tấm kính lớn của cửa sổ, cửa ra vào vẫn còn dán giấy màu che chắn phòng không, giằng chống rung kính.... Năm 1965, toàn trường đi sơ tán ở sát biên giới TQ, bám theo dọc sông Kỳ cùng, trên Lạng sơn: tất cả giáo viên, sinh viên, các bộ phận phục vụ.. trên đó gọi là Khu C. Năm 1972, khi Mỹ ném bom đánh phá MB và HN trở lại, trường ĐHBK lại khăn gói đi sơ tán ở Hiệp Hòa, Hà bắc.